Depuis 2002, grâce au Fonds de l'Environnement de Shell, le GIRB met en place des activités d’incubateurs d’alevins d'omble de fontaine (ou truite mouchetée). Il s’agit d’un aquarium équipé d’un système de refroidissement et de filtration de l’eau. En 2008, les 9 écoles du bassin versant participaient au projet : Beaumont, La Durantaye, St-Anselme, St-Charles, St-Gervais, St-Lazare, St-Michel, Saint-Raphaël et St-Vallier.
En 2009, 7 écoles participaient : Beaumont, La Durantaye, Saint-Charles, Saint-Gervais, Saint-Michel, Saint- Raphaël et Saint-Vallier. Cela représentait environ 150 enfants.
De février à juin, les élèves du primaire ont nourri et veillé sur les alevins donnés par la pisciculture des Alleghanys. En juin, les poissons ont été relâchés dans un milieu propice de la Boyer sud. En 2008, ce sont 725 truites qui ont été ensemencées dans la rivière Boyer !
Cette activité est complémentaire à la plantation d’arbres dans les bandes riveraines. Celles-ci contribuent grandement à améliorer la qualité de l’habitat du poisson en fournissant de l’ombre dans le cours d’eau. Les espèces comme les ombles de fontaine sont sensibles aux variations de température.